很久很久以前，有一名英国水手名叫格列佛，在一次大风暴中他的船只沉没了，他被海浪冲到了一个不知名的小岛上，这座小岛上生活的都是身高几英寸的小人，他们从来没有见过这么高大的人，这引发了国王在内所有人的好奇，并在接下来发生了很多很多有趣的事儿。
皇帝让格列佛学习小人国的语言，并供给他足够的食物。经过各方面考查，几度表示友好，格列佛终于获得自由。在他的帮助下，小人国轻易地战胜邻国的舰队。他因此得到皇帝优厚的封赏，却因为不肯继续灭了邻国而得罪皇帝。
有一次皇宫失火，他用尿浇灭皇后寝宫的大火，招来皇后及一些大臣不满。海军大臣因为妻子与格列佛交往而嫉妒，财政大臣则认为格列佛食量太大，长此以往，将引起国库空虚。
皇帝心中隐藏的不满被皇后和大臣们激发出来，终于秘密决定，刺瞎格列佛的双眼，然后慢慢减少他的饮食供应，直到将他饿死。格列佛得到消息后逃往邻国，奇迹般得到一艘小船，在邻国皇帝的帮助下修好小船，离开了这个小岛。在海上漂流一阵后，遇到一艘英国航船，终于得以回归祖国。