六孔陶笛的指法分为全按五的指法、全按一的指法、全按四的指法，全按五的指法有34567、34567，全按一的指法67123、12345，全按4的指法是45671、23456。
六孔陶笛吹奏的时候手指都有具体的位置，六孔陶笛的正面左边从上到下分别是左手的中指和左手的食指，右边是右手的中指和右手的食指，对面左边对应的就是左手拇指，右边对应的就是右手的拇指。
六孔陶笛在学习的时候可以买一本学习的简谱，先从简单的乐理知识开始学习，然后再学习复杂的指法，指法学习的时候也是非常简单的，只要学会不同音的吹法，根据乐理书的指法练习，很快就可以学会。
和六孔陶笛指法一样重要的就是六孔陶笛的气息控制，吹奏的时候要学会调整气流和吹气时嘴巴的动作。六孔陶笛的结构组成比较简单，正面有四个孔，背面有两个孔，背面是用两只手的拇指控制的，背面是由剩余的手指控制的。
一般在吹奏的时候都是由双手的无名指托住陶笛的底部位置，方便吹奏的时候手指的活动，六孔陶笛是非常怕摔的乐器，在吹奏的时候要十分注意。