《重启之极海听雷》的故事，发生在《盗墓笔记》的十年后，或许更久一点，此时小哥张起灵已经从青铜门中出来，铁三角过了一段平静的生活，但这种生活被三叔的一条短信打破。
在福建雨村隐居的吴邪收到了一条吴三省发来的短信，通过吴三省的线索，找到一个可能与吴三省过去有关的古墓，即传说的南海王墓，于是打算前去一探究竟。
而金万堂有意无意间将吴邪的计划透露给了二叔，二叔在半路截住了吴邪，听说了事情的原委后索性亲自夹了趟喇嘛，同吴邪、胖子、张起灵三人一同前往寻找南海王墓。
其实，《重启》的整个故事都是二叔吴二白设的局，他设计所有人去雷城，说是那里可以治吴邪的病，本次听雷之旅，策划人就是二叔，执行人是闷油瓶和黑眼镜，指定参与者是花儿爷、王胖子、哑女、白昊天、刘丧，强行参与者焦老板、阿宁的弟弟，被蒙在鼓里的人则是本剧的男主——吴邪。
《重启》中的吴邪，和《盗墓笔记》、《沙海》里的吴邪都有所不同，《盗墓笔记》的结局是吴邪的执念，以至于此后十年，他一直活在这样的执念里。
他一直怨恨自己能力不够，保护不了身边的人，连累他们遭遇悲惨的命运：他眼睁睁看着阿宁在他面前变成一具尸体，眼睁睁看着文锦进入陨玉再没有出来。
霍老太太死了秀秀失去了亲人，三叔失踪了，失去云彩的胖子像丢了魂，潘子用生命成就了“莫回头”的小三爷，小哥则代替他自己进入青铜门十年，吴邪将悲剧归咎于自己，这份负罪感成为了他的心障。萦绕十年，从未减轻。
直到小哥回归，雨村平静的生活，是他这十几年最轻松的时光，三叔的短信却打破了这份平静。
小说的结局填了许多的坑，比如陈文锦进陨玉是为了缓解尸化，后来她出现在蛇沼是因为中途突然醒了，她不离开是因为被限制了，闷油瓶失忆是因为天授。
但也多了很多新坑，比如别人不会醒陈文锦会醒的原因，是什么限制了她自由出入，天授给闷油瓶的指令是什么，为什么天授就会失忆，吴邪的病到底会不会好，二叔到底在其间起了什么作用等等。