眼睛的自我保护
打坐，在身心放松状态下，气血顺畅，身体某些不适部位就会更加明显。眼睛流泪，可能是对眼睛的自我保护调节，眼泪滋润眼球。
身体的排毒体现
打坐可以调节身心，促进血液循环，而在打坐时不由自主的流眼泪有可能是排出身体毒素。毕竟眼泪的形成除了泪腺之外，还有其他腺体参与。这与运动后出汗有排毒作用有相似之处。
打坐比较容易想起伤心事
打坐时，身体是在放松的状态下，不受外界环境的影响。而这时大脑并不是没有运转，反而容易浮现往事，如果想起悲伤的事就容易流眼泪。
眼睛注意力集中时间过长
有些人在打坐时并不是闭眼的，而是喜欢睁开眼眺望远方，或无意识的看着前方某一点。当打坐时间长了之后，眼睛容易酸，出现流泪的情况。
正常现象，因为平常用眼过度，紧张。打坐时候放松下来，眼睛在自我调解。你可以继续去感觉眼睛部位，应该能够感受到有发涩，麻等等感觉。
是因为你在念经的时候心有杂念，境有旁骛，没有稳定心神，或者是心有烦恼，气感胸闷，心灵忧郁，不开心和不快乐，或者是心里有负担和压力，或者是上火着急，身体不适，而造成的心里不稳定和精神不稳定，才产生了身体的偏差和心灵的烦乱，也使你在念经打坐时心灵不能真正的入境。
在这样的心灵状态下，就算是你在念经和打坐，但是也会导致你经络不通，气血逆行，或者是穴道受阻，还有的不能进行周天的循环。使你在打坐和念经的时候，产生心灵的疑问和感态的下降，与大脑思维的神经和心灵的感知神经产生了气感的冲创，而导致了心灵的郁闷，而不能入静，心态也不能平衡，也会导致你的心念和你的意神不能控制自己的心态，也会使你的心灵产生飘忽不定的感觉。而在这样的心灵的感觉中，还会使你念经和打坐时，心神不能合一，形神不能合一，气感不能合一，人心和外境不能合一。让你随自心的烦乱和随意的心态所走，而没有无形无意和顺其自然，就像大河之流水而顺流东下。使你的心神和你外境念经打坐，产生了意念抗衡和心灵分神，没有达到万念归一而各走各道。所以说，才产生了你在念经打坐的时候，身体不由自主的晃动，或者是打哈欠和流眼泪，或者是身体不适。