南京牛首山一日游，时间大约需要6个小时。游玩的路线可以按照以下路线进行：由东入口进入景区游览，先游览牛首广场，接着由牛首广场乘坐游览车经天阙路至佛顶寺参观游览，然后由佛顶寺乘坐游览车至佛顶圣境。
此时大概是中午十一点半左右，可以步行至佛顶宫，去尝一尝他们的素斋。
吃完饭稍微休整一下，开始游览舍利大殿（舍利大殿就在佛顶宫里）。游览完舍利大殿以后，由佛顶宫步行至佛顶塔参观外部景观，后乘坐游览车至郑和文化园游览。
然后从郑和文化园出发，沿禅林路徒步游览。整个牛首山就算游览完毕了。
也就是说，整个牛首山的主要参观地点有以下几个：牛首广场佛顶寺—佛顶塔—佛顶宫—郑和文化园—禅林路景观带。
从南京到牛首山，可以乘坐G70、754、755公交车至牛首山风景区东下车，还可以乘坐712公交车至牛首山风景区下，到达景区东入口。
也可以乘坐710公交至周村站下，步行至景区西入口。