艾灸是用艾叶制成的艾灸材料产生的艾热刺激体表穴位或特定部位，通过激发经气的活动来调整人体紊乱的生理生化功能，从而达到防病治病目的的一种治疗方法。
艾叶制作成艾柱或艾条通过燃烧产生近红外和热量作用于人体穴位或特定的部位,从而达到预防和治疗的自然疗法。艾灸起作用的原理一方面是用热力达到温通经络，行气活血，驱寒除湿等效果。
另一方面是借助艾草本身的药力，因为艾草是中药中少有的能通十二条经络的药物，所以古人经过多年的摸索，最终将艾草定为施灸的主要原料。第三个原理是根据身体情况灸不同的穴位，使用不同的施灸手法。
现代研究还发现艾灸燃烧时产生的热量，是一种十分有效并适应于机体治疗的物理因子红外线。根据物理学的原理，任何物体都可以发射红外线和吸收红外线，人体也不例外。
近红外线对人体的穿透深度较远红外线深，最多可达10mm，并被机体吸收。研究认为，艾灸在燃烧时产生的辐射能谱是红外线，且近红外线占主要成分。红外线可激励人体穴位内生物分子的氢键，产生受激相干谐振吸收效应，通过神经-体液系统传递人体细胞所需的能量。
艾灸时的红外辐射可为机体细胞的代谢活动，免疫功能提供所必需的能量，也能给缺乏能量的病态细胞提供活化能。而艾灸施于穴位，其近红外辐射具有较高的穿透能力，可通过经络系统，更好地将能量送至病灶而起作用。另外一项现代研究表明，艾燃烧生成物的甲醇提取物，有清除自由基作用，并且比未燃烧的艾的甲醇提取物作用更强。
施灸局部皮肤中过氧化脂质显著减少，此作用是艾的燃烧生成物所致。艾的燃烧不仅没有破坏其有效药物成分，反而使之有所增强。艾燃烧生成物中的抗氧化物质，附着在穴位处皮肤上，通过灸热渗透进入体内而起作用的。
艾灸养生穴位
灸身柱穴
身柱穴属督脉，在项后第三胸椎与第四胸椎之间。身柱穴有理肺气，补虚损，解疗毒，宁神志的功效。灸身柱能温补元阳，调和气血，促进青少年的生长发育，现代研究认为，灸身柱可以调节人的神经系统，可以防止神经衰弱，失眠症，头痛的发作，可以防止疲劳，促进肌体体力的恢复。灸身柱对小儿的胃肠道疾病，如消化不良，吐乳，泄泻，食欲不振等有防治作用。
此外，对精神萎靡、夜哭，呼吸系统的哮喘、气管炎、百日咳、感冒、肺炎等都有防治作用。《养生一言草》载：小儿每月灸身柱、天枢，可保无病。艾灸身柱穴有理肺气，补虚损，解疗毒，宁神志的功效
灸大椎穴
大椎穴属督脉，在第7颈椎与第1胸椎之间。大椎穴又名百劳穴，是督脉、手足三阳经、阳维脉之会，有“诸阳之会”和“阳脉之海”之称。此穴有解表、疏风、散寒，温阳、通阳、清心、宁神、健脑、消除疲劳、增强体质、强壮全身的作用。
现代研究发现艾灸大椎穴，可增加淋巴细胞的数量，提高淋巴细胞的转化率和E一玫瑰花环形成率，具有提高机体细胞免疫的功能。艾灸此穴，可用于老年人项背畏寒，用脑过度引起的疲劳、头胀、头晕，伏案或低头过度引起的项强不适、颈椎病，血管紧张性头痛等。大椎穴还有明显的退热作用，艾灸大椎穴，能防治感冒、气管炎、肺炎等上呼吸道感染，还可用于肺气肿、哮喘的防治。
灸中脘穴
中脘穴属任脉，位于腹部正中线，脐上4寸。中脘穴有调胃补气、化湿和中、降逆止呕的作用。《甲乙经》载：“胃胀者腹满胃脘痛，鼻闻焦臭妨于食，大便难，中脘主之，亦取章门。”又载：“伤忧思气积，中脘主之。”《玉龙歌》说“黄疽四肢无力，中脘、足三里。”
实验观察发现，艾灸小白鼠“中脘”穴，能增加单核巨噬细胞的吞噬功能，艾灸中脘穴后能使胃的蠕动增强，幽门立即开放，胃下缘轻度提高，空肠黏膜皱襞增深、肠动力增强。艾灸中院有利于提高脾胃功能，促进消化吸收和增强人的抵抗力，对于胃脘胀痛、呕吐、呢逆、吞酸、食欲不振等有较好疗效。
灸关元穴
关元属任脉，位于腹部正中线，脐下3寸。该穴为小肠之“募穴”，足三阴经、任脉之会，一身元气之所在。别名“丹田”。《难经·六十六难》集注中杨玄操说：“丹田者，人之根本也，精神之所藏，五气之根元，太子之府也。”
中医学认为，关元其部位为真阳所居、化生精气之处。艾灸关元能使清阳上升，浊阴下降，元阳温暖，血液充盈，能培肾固本，补气回阳，通调冲任、理气活血。艾灸关元，能治积冷，男子疝气，梦遗淋浊，女子瘕聚，经产带下，诸虚百损。艾灸关元可防治遗尿、尿频，隆闭、少腹胀痛，脱肛、疝气、遗精，白浊、阳痿、早泄，月经不调、经闭、痛经、崩漏、恶露不尽、不孕，中风脱证、虚劳赢瘦等。
灸气海穴
气海属任脉，位于腹部正中线，脐下1.5寸。
灸气海有延年益寿、养生保健的作用。据《旧唐书》卷一百六十五载，柳公度年八十余，步履轻便，当有人问其养生之术时，他说：“吾初无术，但未尝以元气作喜怒，气海常温耳。”灸气海能生发和培补元气，滋荣百脉，益肾固精，保健强身，解除疲劳等。
据《窦材灸法》记载：“上消病，日饮水三至五升，及心肺壅热，又吃冷物，伤肺肾之气……春灸气海，秋灸关元三百壮，口生津液。"认为灸气海能预防阑尾炎。日本代田文志(现代日本针灸学家)认为用艾灸气海可预防阑尾炎，他说：为顿挫阑尾炎而灸20～3O壮。
现代研究发现，艾灸实验性关节炎大白鼠的神阙穴，其炎症区坏死程度及细胞浸润明显减轻，隔盐灸正常小白鼠的神阙穴，其杀伤细胞活性，在24小时内迅速升高，72小时至120小时复原，若间日连续灸，则活性升高可维持更长的时间。
灸神阙还能治泄泻、便血及病后大便不通。据《窦材灸法》载：“肠癖下血，久不止，此饮食冷物，损大肠气也，灸神阙穴三百壮;虚劳人及病后大艾灸神阙穴，对泄泻、绕脐腹痛、脱肛、中风脱证、角弓反张、产后尿潴留、慢性腹泻、皮肤瘙痒、荨麻疹有效好的防治作用。
灸足三里穴
足三里属足阳明胃经。位于小腿的前外侧，在犊鼻下3寸距胫骨前缘一横指。足三里是胃经的主要穴位，具有调理脾胃.健运脾阳，温中散寒，补中益气，调和气血.宣通气机，导气下行，补虚强身的作用。
现代研究认为艾灸足三里穴.能调节高血压病初期患者的中枢神经系统.具有降血压的作用.能使纤维蛋白降解产物下降，可以改善血液出黏滞度.并有扩张血管，降低血液凝聚的作用，可以预防脑血管意外的发生。艾灸足三里，还能增强消化吸收能力，改善铜、锌代谢，减少动脉硬化和冠心病的发生。