横断山脉在气候上受高空西风环流、印度洋和太平洋季风环流的影响,冬干夏雨,干湿季非常明显。一般5月中旬至10月中旬为湿季,降水量占全年的85%以上,不少地区超过90%,且主要集中于6、7、8三个月。从10月中旬至~次年5月中旬为干季,降雨少,日照长,蒸发大,空气干燥。
横断山脉的气候有明显的垂直变化,高原处年均温14~16℃,最冷月6~9℃,谷地处年均温可达20℃以上。南北走向的山体屏障了西部水汽的进入,如高黎贡山东坡保山,年降水量903毫米,年均相对湿度70%,西坡龙陵年降水量2595毫米,年均相对湿度83%。
横断山脉的植被和土壤依气候、地势而变,从东南到西北,可划分为:1.边缘热带季雨林——红壤带。2.亚热带常绿阔叶林——红壤黄壤带。3.暖温带、温带针阔叶林——褐色土、棕壤带。4.寒温带亚高山森林草甸——暗棕壤和亚高山草甸土带。“十里不同天”就是说在垂直方向上不同高度的气候类型也不同。气候类型的不同了造就了所谓的“一山有四季”。
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