牛奶蛋白对宝宝来说是一种异种蛋白。牛奶蛋白中某些成分，如β-乳球蛋白有很强的致敏性，会导致宝宝发生过敏。
水解蛋白配方奶粉就是将牛奶中肽链较长、容易引起过敏的大分子牛奶蛋白，分解成较小的中链和短链，以降低蛋白质过敏原性。使改良后的牛奶蛋白致敏性降低，由此经过水解得到的蛋白就是水解蛋白。这种配方更适用于肠道未发育完全的0~12个月宝宝。
根据水解程度的不同，可以将水解蛋白配方分为部分水解配方奶粉(pHF)和深度水解配方奶粉(eHF)。
部分水解与深度水解蛋白奶粉有何不同?
部分水解蛋白配方奶粉(也称低敏奶粉)，把高致敏性的普通牛奶蛋白经过酶解变成低致敏性的小分子蛋白，致敏性降低1000倍，适合于所有新生儿尤其是有过敏史的宝宝食用。它与普通的配方奶粉相比，营养成分相同，过敏源含量少。可长期食用。
深度水解蛋白配方奶通过特殊工艺将牛奶中引起过敏的大分子牛奶蛋白变成短肽及氨基酸结构，无致敏性，适用于婴儿过敏的治疗。不可长期食用。
部分水解蛋白配方粉主要用于牛奶过敏的饮食预防，而深度水解蛋白配方粉可用于大部分轻到中度牛奶蛋白过敏的饮食治疗。
深度水解和氨基酸配方奶粉会产生一些苦味物质，影响配方的自然口感，特别是深度水解酪蛋白配方。部分水解蛋白配方粉比起深度水解和氨基酸配方奶粉的味道也比较可口，容易被宝宝接受，特别是6个月以上的婴儿。
水解蛋白奶粉的作用及好处
临床证实,乳蛋白部分水解配方能在24小时内有效减轻多种消化不适：吐奶次数减少36%，哭闹时间减少33%，烦躁不安减轻31%，胀气减轻26%，排便频率持续改善，便便维持松软。
1、减少婴儿肠胃不适，有效减少婴儿烦躁哭闹现象
除了饿了、困了、累了等原因，宝宝的肠胃不舒服也是哭闹的常见原因，小宝宝的肠道发育尚未完善，百天之内的宝宝经常会出现胀气，因此民间有“新生儿百日哭”的说法。
如果宝宝是混合喂养，每日都会出现无规律阵发性哭闹、吐奶、排气多，排便次数多且大便稀，就应考虑是不是牛奶蛋白不耐受或者乳糖不耐受。可以尝试更换部分水解蛋白同时较低乳糖的配方奶粉。
2、保证婴儿正常排便，减少便秘及腹泻
对于婴儿无规律地阵发性哭闹、吐奶、排气多、排便次数多且大便稀，如果是混合喂养，将普通配方奶粉替代成部分水解蛋白配方奶粉后，腹胀和腹泻症状有所好转，可考虑是牛奶不耐受。
婴儿对于牛奶不耐受分为两种情况：
1、牛奶蛋白过敏。新生宝宝肠粘膜发育和肠道菌群不成熟时添加配方奶粉，可能会诱发牛奶蛋白过敏。医生建议，给新生宝宝添加配方奶粉时，可优先选择部分水解蛋白配方。
2、乳糖不耐受。新生宝宝肠道内的乳糖酶不足，不能很好地分解配方奶中的乳糖，致使乳糖进入结肠，被细菌分解产生很多气体，同时吸收很多水分，就会出现腹泻
3、有效减少吐奶现象的发生
把配方奶粉中的牛奶蛋白比作一整串珍珠，宝宝很难消化一整串长长的牛奶蛋白，或者会对牛奶蛋白敏感，使胃部起反应从而出现吐奶的症状
现在，在五个点把那串珍珠断开，就可以得到五六小串珍珠了。这些部分水解的蛋白质，更容易被宝宝消化和吸收。
如果把这些小串再次分解，就会得到更小的牛奶蛋白片段，这就是更易消化的深度水解蛋白配方奶粉。
4、减少湿疹的发生
专家提示：有家族过敏史的宝宝，有可能会成为乳蛋白过敏高风险宝宝，考虑选用部分水解蛋白配方奶粉帮助预防或延迟宝宝过敏症状发生。
所以，即使宝宝并没有出现过敏症状，而爸爸或妈妈任何一方有过敏症状或对牛奶蛋白不耐受，请在给宝宝选择配方奶粉时，优先考虑部分水解蛋白配方奶粉，帮助预防或推迟宝宝早期特应性皮炎和牛奶蛋白过敏症状的发生。
5、有助于宝宝更好地睡眠
夜惊的原因也可能是宝宝肠胀气造成的。肠胀气常发生在3个月以内的婴儿身上，宝宝的消化系统尚未发育成熟，宝宝会有不安、脸部胀红、腿弯曲和腹壁僵硬的现象，也常会臭屁连连。
由于消化系统功能不完善，宝宝出现肠胀气。这是宝宝夜惊的最大原因之一。
对于肠胀气造成的夜惊，妈妈可考虑给宝宝更换部分水解蛋白配方奶粉。经过蛋白酶水解工艺处理的配方奶非常容易被宝宝消化吸收能让宝宝睡得更安稳。
特别注意：深度水解蛋白奶粉、氨基酸奶粉不宜长期食用!
由于完全水解蛋白的蛋白质分子量很小，免疫系统不会对它产生有效的免疫应答。
部分水解蛋白分子量虽然比普通牛奶小很多，但依然保留了部分具有免疫活性的肽段，因而可以温和地训练免疫系统。
如果把蛋白质彻底分解为氨基酸分子，就成为以氨基酸分子为基础的脱敏营养奶粉，主要用于治疗婴幼儿过敏，不适合长期食用。
临床上，严重过敏的婴幼儿，需要吃一段时间的完全水解蛋白配方奶粉，而随着年龄增长带来的消化、免疫、皮肤保护层的不断发育完善，就可以逐渐改为部分水解蛋白配方奶粉。
而孩子的免疫功能、消化功能、皮肤抗击外界病菌侵害的能力都随着年龄的增长在不断完善。一般婴幼儿到了3岁对牛奶蛋白的耐受性就会大大增强，不再对牛奶蛋白过敏。